PRAGOPROJEKT, a.s. provádí samostatná řešení vodohospodářských částí dokumentací staveb dálnic, městských komunikací, mostů, obytných souborů a průmyslových areálů, dokumentace přeložek a nově navrhovaných vodovodů, kanalizací, a dále dokumentace pro úpravy toků, čištění a akumulace vody, meliorace a hydrotechnické výpočty. Vzhledem k tomu, že jsou tyto dokumentace součástí dopravních staveb uvedených v části silnice a dálnice, nejsou zde samostatně prezentovány.